MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR12

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022601	CCA	2	6	10	15	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_022601	CAA	2	6	33	38	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022601	GTT	2	6	1296	1301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022601	TAAAAT	2	12	1488	1499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022601	TA	3	6	1594	1599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022601	TTAC	2	8	1638	1645	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_022601	A	6	6	1652	1657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022601	TA	3	6	1675	1680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022601	TACT	2	8	1732	1739	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022601	TTG	2	6	1774	1779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022601	TTG	2	6	1796	1801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022601	TTG	2	6	1818	1823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022601	TTG	2	6	1840	1845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022601	TA	3	6	1878	1883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022601	T	6	6	1892	1897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022601	AATC	2	8	1922	1929	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_022601	ATT	2	6	1934	1939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022601	T	6	6	1953	1958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022601	AATG	2	8	1969	1976	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022601	T	7	7	2716	2722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022601	GGT	2	6	2776	2781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022601	TTAGA	2	10	3394	3403	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022601	T	6	6	3940	3945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022601	ATTA	2	8	3950	3957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022601	ATG	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022601	T	6	6	3973	3978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022601	TAAAA	2	10	3993	4002	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022601	CTCTC	2	10	4588	4597	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_022601	GGA	2	6	4646	4651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022601	A	7	7	4658	4664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022601	TAG	2	6	4718	4723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022601	T	6	6	4732	4737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022601	A	7	7	4765	4771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022601	AGG	2	6	4801	4806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022601	A	6	6	5673	5678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022601	CTT	2	6	5693	5698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022601	T	6	6	5697	5702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022601	TA	3	6	5712	5717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022601	TTA	3	9	5721	5729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022601	TAAA	2	8	6239	6246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022601	TCC	2	6	6962	6967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_022601	TAT	2	6	6981	6986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022601	TAG	2	6	7001	7006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022601	AGTA	2	8	7057	7064	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022601	A	6	6	7070	7075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022601	CAAT	2	8	7083	7090	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_022601	GAA	2	6	7102	7107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022601	A	6	6	7106	7111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022601	A	6	6	7157	7162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022601	T	7	7	7181	7187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022601	AAG	2	6	7207	7212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022601	CT	3	6	7262	7267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_022601	CTTGG	2	10	7277	7286	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_022601	TGCC	2	8	7306	7313	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_022601	CT	3	6	7833	7838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_022601	GAC	2	6	7869	7874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022601	TTC	2	6	7893	7898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_022601	ATT	2	6	7907	7912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022601	TAAA	2	8	7939	7946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022601	TCC	2	6	8662	8667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_022601	TAT	2	6	8681	8686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022601	TAG	2	6	8701	8706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022601	AGTA	2	8	8757	8764	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022601	A	6	6	8770	8775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022601	CAAT	2	8	8783	8790	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_022601	GAA	2	6	8802	8807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022601	A	6	6	8806	8811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022601	T	7	7	8880	8886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022601	AAG	2	6	8906	8911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022601	CT	3	6	8961	8966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_022601	CTTGG	2	10	8976	8985	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_022601	TGCC	2	8	9005	9012	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_022601	CT	3	6	9532	9537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_022601	GAC	2	6	9568	9573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_022601	TTC	2	6	9592	9597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_022601	ATT	2	6	9606	9611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022601	TAAA	2	8	9638	9645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022601	TCG	2	6	10216	10221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_022601	TCC	2	6	10913	10918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_022601	TCACC	2	10	11290	11299	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
81	NC_022601	GTA	2	6	11319	11324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022601	TAT	2	6	11372	11377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022601	A	6	6	11437	11442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022601	GGA	2	6	11453	11458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022601	A	6	6	11983	11988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022601	T	8	8	12002	12009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022601	T	6	6	12026	12031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022601	A	6	6	12046	12051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022601	AGA	2	6	12340	12345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022601	GA	3	6	12374	12379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022601	GA	3	6	12400	12405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022601	CG	3	6	12595	12600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_022601	CAA	2	6	12606	12611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.